8ヶ月の男児ですが、全身アトピーのため3ヶ月ほど前から乳酸菌とミネラルの摂取を続け、蓬水処置でがんばっています。

水疱瘡や嘔吐下痢、風邪などはすべて自然治癒できました。

3日ほど前から40度前後の熱を出し、今日やっと平熱に戻ったかと思うと赤く細かい湿疹が出てきました。
突発性発疹かもと思い、念のため病院で診察。
そこで、扁桃腺が腫れて赤いので溶連菌感染症の疑いもあるとのこと。
その場合、抗生剤を10日以上服用しないといけないそうなのですが、せっかくここまで薬なしで治癒してきたので悔しくて。
かといって子供を危険な目にさらすことはできないので、悩んでいます。
溶連菌感染症を調べましたが、やはり危険なことも書いてますし、子供には自然治癒するのは危険かなと思っています。

とても悩んでいます。
お忙しいと思いますが、ご返答いただければ幸いです。
よろしくお願いします。